Milli Takım'ın 2016 Avrupa Şampiyonası elemeleride karşılaşacağı Çek Cumhuriyeti ve Letonya maçları öncesi Ömer Toprak sakatlığı nedeniyle kadrodan çıkarıldı.
Bayer Leverkusen'in 2-2 berabere kaldığı Paderborn maçı sonrası sakatlığı gerekçe göstererek kampa katılmayan Ömer Toprak cezası nedeniyle sadece Letonya maçında oynayacaktı.
Milli Takım kampına katılmayan Ömer Toprak'ın “Takım ortamından hoşlanmıyorum ve orada olmak istemiyorum” diyerek sakat olduğunu ileri sürüp kadroya dahil olmadığı iddia edildi.

