İkinci yarıda da vites düşürmeyen ev sahibi ekip, 2. gol için yüklenmeye devam etti. Atletico, özellikle son dakikalarda Arda'nın da etkili oyunuyla tur golüne yaklaşsa da 90 dakika 1-0 sona erdi ve maç uzatmalara gitti.
Ancak uzatmalarda da gol sesi çıkmayınca maçta penaltılara gidildi.
Seri penaltı atışlarını Atletico Madrid, 3-2 kazanınca çeyrek finale yükselen taraf oldu. Öte yandan Leverkusen'de penaltı kaçıran isimlerden ikisi de Ömer Toprak ve Hakan Çalhanoğlu oldu.